Выгоднее строить военный аванпост. Он будет защищен от врагов, и к нему бонусом идет военный отряд. Единственный минус от такого выбора: жалобы местных на милитаризацию планеты, но на игру это никак не влияет.
Если же выбрать научный аванпост, жители жаловаться не будут, но толку от этого никакого. Придется дополнительно захватывать базу врага, чтобы использовать ее для защиты поселения.