Для того, чтобы вставить руну в скилл нужно открыть умения и сбоку найти вкладку "Руны". Здесь есть шесть свободных ячеек под руны и столько же под скиллы. Слева выбираем скилл и перетаскиваем его в ячейку, а снизу из рюкзака рун берем, соответственно, руну.
Чем выше уровень руны, тем больше положительных характеристик она дает.