Зайдите в Мои документы и там будет папка Prototype. В ней есть файл profile.bin, который отвечает за настройки. Скопируйте всю папку, на всякий случай, а затем удалите этот файл и игра должна запуститься со стандартными настройками. Еще можете попробовать запустить игру в разрешении 640х480. Для этого нажмите правой кнопкой мыши по ярлыку игры и выберете Свойства, после чего нужно нажать вкладку Совместимость и там поставить галочку на нужно пункте. После того как зайдете игру и исправите настройки графики, то можно снова из нее выйти и убрать эту галочку.